以及結合最新的公開資料，轉讓公司糾紛的案由通常包括以下幾個方面：

股權轉讓合同效力的糾紛：這涉及到轉讓方和受讓方之間就股權轉讓合同的有效性產生的爭議，可能包括違反法律規定、公司章程或其他股東之間的協議等問題。

股權轉讓合同履行的糾紛：這類糾紛通常涉及已生效的股權轉讓合同在履行過程中的各種爭議，例如支付轉讓款、辦理股權變更登記等環節出現的問題。

瑕疵出資股東股權轉讓糾紛：當轉讓方自身對公司的出資存在瑕疵（如未按時足額繳納出資）時，可能會引起受讓方或公司的其他成員對轉讓行為提出的異議。

股權轉讓中的瑕疵責任：這涉及到因股權轉讓過程中出現的過錯或疏漏而導致的責任歸屬問題，可能包括誤導、隱瞞或欺詐行為等。

國有股權轉讓糾紛：這類特殊的股權轉讓糾紛涉及到國有股權的轉讓，除了適用一般股權轉讓的規定外，還需遵循有關國有資產監管的特別規定。

其他特殊類型的股權轉讓糾紛：這可能包括股權的繼承、分割、遺贈，以及夫妻共有的股權所產生的法律糾紛等。

值得注意的是，隨著經濟社會的發展和公司法律實踐的豐富，新的股權轉讓糾紛類型也可能不斷出現，且各地法院在審理這些案件時可能會有不同的理解和判斷。因此，在處理具體的公司轉讓糾紛時，建議咨詢專業的法律顧問，并根據具體情況選擇合適的解決途徑，如協商、調解、仲裁或訴訟等。