，公司股權溢價轉讓會計分錄如下：

當企業發生股權變更轉讓時，股權轉讓溢價應作為投資收益。在收到新的投資款時，應做會計分錄：

借：銀行存款（轉讓價款）

貸：長期股權投資（長期股權投資賬面價值）

投資收益（轉讓價款扣除投資賬面價值）

其中，長期股權投資主要包括投資方對被投資單位實施控制、重大影響的權益性投資，以及對其合營企業的權益性投資。除上述以外其他的權益性投資，包括風險投資機構、共同基金，以及類似主體持有的、在初始確認時按照《企業會計準則第22號——金融工具確認和計量》的規定以公允價值計量且其變動計入當期損益的金融資產，投資性主體對不納入合并財務報表的子公司的權益性投資，以及其他權益性投資，應當按照《企業會計準則第22號——金融工具確認和計量》等相關準則進行會計處理。

需要注意的是，股權轉讓需要繳納增值稅、企業所得稅、個人所得稅、印花稅等稅費，稅率一般是20%。在確定股權轉讓的計稅基礎時，需要遵循一定的原則和規定。股權的原值即計稅基礎，是指股權轉讓人投資入股時向中國居民企業實際支付的出資成本，或購買該項股權時向該股權的原轉讓人實際支付的股權受讓成本。對于個人所得稅的計算，應按照《股權轉讓所得個人所得稅管理辦法(試行)》的規定，具體公式為：應納稅額=(股權轉讓收入-股權原值-合理費用)*20%。

在進行公司股權溢價轉讓時，應根據相關規定進行會計處理，并繳納相應的稅費。如有疑問，建議尋求專業的財稅顧問的幫助。